RT @Ignamelero: 1/7 Excited to share our new preprint! @JFriedman_micro @EvolSys We explored evolutionary rescue in microbial communities,….

Si quereis conocer más detalles, éste es el hilo en inglés escrito por el propio @RELenski, donde podréis encontrar enlaces a los manuscritos originales: Fin del hilo.

A nivel práctico, toda vez que las grandes adaptaciones iniciales son a menudo las que marcan la diferencia entre la supervivencia y la extinción, nuestros resultados suponen una inyección de moral a los esfuerzos para predecir la evolución de patógenos (p. ej, @nextstrain).

Los lectores más “frikies” reconocerán aquí una versión biológica del demonio de Laplace (. Lo que vimos es que sólo las grandes adaptaciones iniciales son predecibles de esta forma. En otras palabras, que el demonio existe pero es terriblemente míope.

El segundo trabajo, en el cual firmo con @ten_olivier, se centra en las mutaciones beneficiosas. Partimos de un planteamiento casi filosófico: si pudiésemos conocer todas las mutaciones beneficiosas posibles para un organismo en un momento dado ¿podríamos predecir la adaptación?.

Esta constancia obliga a replantear modelos acerca del concepto del genoma mínimo, y tiene implicaciones prácticas tanto en biotecnología (creación de bacterias sintéticas) como en medicina (búsqueda de dianas para antibióticos que se mantengan invariables a largo plazo).

Sus observaciones son sorprendentes. Si bien muchos genes superfluos se han perdido con la adaptación, muchos otros genes se han duplicado en los genomas, volviéndose redundantes. El resultado: la fracción de mutaciones letales se ha mantenido invariable durante el LTEE.

El primer equipo, liderado por @anuraglimdi & @baym, se centró en un tipo concreto de mutaciones: las letales. Su pregunta: si la adaptación hace que se pierdan genes redundantes, ¿se vuelven los organismos más “frágiles”, cada vez menos capaces de tolerar nuevas mutaciones?.

Pues bien, una reciente tecnología nos permite meter cientos de miles de mutaciones en microbios, y estudiar el efecto individual de cada una de ellas. Dos grupos han aplicado este avance al registro fósil del LTEE para ver si el efecto de las mutaciones cambia con la adaptación.

Tras esos >30 años, las bacterias del LTEE se han adaptado tan bien que crecen >70% más rápido que su ancestro de 1988. Como referencia, en un partido de baloncesto tal diferencia equivaldría a una victoria aplastante por >40 puntos – como hacía el Dream Team en Barcelona’92.

Gracias a esta fantástica propiedad, los investigadores podemos resucitar el registro fósil y medir directamente cómo las bacterias se han adaptado a lo largo del tiempo. Además, podemos usar herramientas de biología molecular para estudiar qué genes influyen en la adaptación.

Desde entonces, en el LTEE han pasado >50,000 generaciones, más que las que llevamos los Homo sapiens en la Tierra. La gracia de las bacterias, sin embargo, es que se pueden congelar y revivir más tarde. Como en aquella película adolescente donde descongelaban a un cavernícola…

Primero, hablemos del Experimento de Evolución a Largo Plazo (#LTEE). En 1988, @RELenski fundó 12 cultivos bacterianos idénticos, con la determinación de estudiar si la adaptación a un medio muy pobre sería determinista o totalmente aleatoria. En las radios triunfaba “Bad”.

Esta semana dos trabajos han ampliado nuestra comprensión de cómo el efecto de las mutaciones varía a lo largo de la evolución. Los estudios han sido posibles gracias un experimento que lleva >30 años evolucionando bacterias en el laboratorio. Un hilo.

RT @ArlinStoltzfus: Recent recorded lecture from Alex Couce @EvolSys "Evolutionary consequences of biased mutation . .

RT @CBGP_Madrid: 📸 Some photos of Maud Tenaillon during her #SeminarCBGP. #somosUPM