学術変革領域研究(A)EPIC Assembly 進化情報アセンブリ
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令和7〜11年度 学術変革領域研究(A)進化アセンブリ学 「進化情報アセンブリによる生命機能の創出原理」の広報アカウントです。 領域HP → https://t.co/H6dIj6CPkH
Joined February 2025
2025年4月より学術変革領域A「進化情報アセンブリによる生命機能の創出原理(略称:進化アセンブリ学; 英語略称: EPIC Assembly)」が開始することになりました。本領域は「高度な生命機能がいかにして現れ、洗練されてきたのか、その創出の原理」をターゲットとします。
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2026年3月に国際シンポジウムを開催します。 EPIC Assembly 2026 Symposium: From Biological Complexity to Evolutionary Principles ・日時:2026年3月14日(土)-16日(月) ・場所:東京大学生産技術研究所 ・形式:ハイブリッド、ポスターセッションあり ・URL:
sites.google.com
イベント情報
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B02班の論文がPRX Lifeに公開されました。強化学習をベースに、細胞集団が環境を記憶媒体として分散的に学習や探索をする最適な方策を導出し、環境への情報の最適な読み出しと書き込み関係性を明らかにしました。細胞アセンブリによる情報処理機能の創出の理解に応用されます。 https://t.co/sph96j77e5
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Letterと同時にfull paperも公開されています。こちらは細胞情報処理の設定に改変したリソース制約付き最適制御理論の詳細や、ベイズなどを利用したこれまでの細胞情報処理の理論研究との関連や整合性などについて詳しく記載しています。 https://t.co/qGpAFlOI5H
journals.aps.org
While the information processing of organisms is evolutionarily optimized, it exhibits remarkable diversity in its complexity and capability. One potential source of this diversity is the limitations...
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B02班の研究がPRRに公開されました。リソース制約付き最適制御理論を細胞の情報処理に応用し、感知やメモリーの内因ゆらぎ、メモリー制御コストなどのリソース変化に従い、情報処理の複雑さに転移が起こることを示しました。生体情報処理の進化への応用が期待されます https://t.co/qBcMqLnzSQ
journals.aps.org
An optimal estimation and control framework is proposed that explicitly accounts for biological resource limitations. Application of this framework to biological information processing shows that...
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領域のB02班(数理情報班)による論文がPREに公開されました。化学反応系のハイパーグラフ構造を保存量に着目してグラフで粗視化する方法と、それに伴う熱力学的な量などの関係を議論しています。様々な反応アセンブリの解析を効率化できると期待されます。 https://t.co/W5RCztZt0Y
journals.aps.org
Chemical reaction network (CRN) theory is widely utilized to model and analyze a wide range of biochemical phenomena. Structural transformations and reductions serve as essential tools to better...
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領域A02班による、サイクリン–CDK複合体の解離定量法を確立した研究が Journal of Cell Science に掲載されました。細胞周期制御機構の定量的理解深化が期待されます。 https://t.co/xG5hC7ty2y
journals.biologists.com
Summary: Phycocyanobilin-bound miRFP670 is bright and photostable, enabling quantitative fluorescent cross-correlation spectroscopy analysis of cyclin–CDK interactions in living fission yeast and...
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領域のB01班による、増殖を伴う自己駆動粒子系の理論モデルの研究がPhys. Rev. Research誌に掲載されました。整列相互作用なしに秩序運動が生じるという、増殖由来の新たな秩序形成原理解明が期待されます。 https://t.co/htWXolImxu
journals.aps.org
While it is well established that self-propelled particles with alignment interactions can exhibit orientational order, the impact of self-replication and annihilation, which are key characteristics...
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領域B01班による、光照射で固体中のスピンに非相反相互作用をもたらすことを提案する理論研究が、Nature Communications に掲載されました。生命系や生態系等で現れる非相反相互作用の物理が、今後固体中で実現することが期待されます。 https://t.co/RnOQvUWyeY
https://t.co/Zx7JdrqcMM
nature.com
Nature Communications - In open nonequilibrium systems, interactions that break the action-reaction symmetry are ubiquitous in nature. While such nonreciprocal interactions have been implemented...
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領域のB02班(数理情報班)による、多様な生体集団の最適な制御則を導く汎用的な制御理論が、PRX life紙に掲載されました。多様な生体アセンブリがどのように機能獲得をするのかを最適な制御則の獲得の観点で解析する方法論を与えると期待されます。 https://t.co/NVMFRWUowg
iis.u-tokyo.ac.jp
東京大学 大学院情報理工学系研究科の堀口 修平 博士課程(研究当時)(現:金沢大学ナノ生命科学研究所特任研究員)と、 #東大生研 兼 生物普遍性連携研究機構 小林徹也教授による研究グループは、細胞内分子群や動物個体群、感染症など、生体集団の示す不確実で予測が困難なふるまいを効果的にコントロールするための新たな理論を開発し、分子モーターの最適な輸送制御則や、集団多様性を維持する最適戦略、そして...
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#iibmp2025 では、当領域からも共催ワークショップを企画しています。 WS-8「物理と進化に学ぶ生命情報学の新展開」 9月4日(木)15:40-17:10 第2会場 https://t.co/nCGcQ1ALyP 進化・情報・物理のそれぞれから領域の成果をご紹介します。ぜひ奮ってご参加ください!
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本領域の公募班に関する説明会をオンラインで開催いたします: 日時:7月22日(火) 12:00−12:20:領域概要(動画再生) 12:20−12:30:公募班についての補足説明 12:30−13:00:質疑 形式:zoomオンライン 領域HPからご��録ください: https://t.co/iREQpvFT4U
sites.google.com
イベント情報
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本領域の公募班に関する説明会をオンラインで開催いたします: 日時:7月22日(火) 12:00−12:20:領域概要(動画再生) 12:20−12:30:公募班についての補足説明 12:30−13:00:質疑 形式:zoomオンライン 領域HPからご登録ください: https://t.co/iREQpvFT4U
sites.google.com
イベント情報
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本学術変革領域Aの公募班公募の公募要領情報が公開になりました: https://t.co/SKLJdQ0ujp 本領域の内容は「公募要領(学術変革領域研究(A)(公募研究)) (PDF:2830KB)」のp55になります。 領域を解説したzenの記事とあわせて御覧ください: https://t.co/cGp3O4w2k1
zenn.dev
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本領域の狙いや背景についての記事がzennで公開されました: https://t.co/cGp3O4w2k1 領域研究の背景から、領域が目指す方向性などを関連する文献とともに紹介しています。 ご覧いただければ幸いです。
zenn.dev
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学術変革A「進化情報アセンブリ」領域の紹介と トヨタコンポン研「未踏探索の原理と限界」の合同シンポジウムが来週に迫りました。 まだ空きがありますので未登録の方は以下からご登録ください! 参加登録(必須): https://t.co/fP1r1yzaj5
docs.google.com
学術変革領域A「進化情報アセンブリ」とトヨタコンポン研探査研究「未踏探索の原理と限界」の合同開催公開シンポジウムになります。それぞれのプログラムは以下を参照ください 6月28日午前:「進化情報アセンブリ」領域紹介シンポジウム 6月28日午後+29日:トヨタコンポン研 探査プロジェクト「未踏探索の原理と限界」公開シンポジウム 当日参加およびオンライン参加には登録が必須ですのでご注意ください。
学術変革A「進化情報アセンブリ」領域の紹介シンポジウムおよび領域と関係するトヨタコンポン研シンポジウム「未踏探索の原理と限界」を同時開催します。参加をお待ちしております!日時:6月28日(土), 29日(日) 場所:東京大学生産技術研究所 (現地およびオンラインのハイブリッド開催)
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バイオインフォマティクス学会2025で本領域が共催するワークショップ「物理と進化に学ぶ生命情報学の新展開」が開かれます。日時:9月3-5日 場所:名古屋大学 皆様奮ってご参加ください! https://t.co/nCGcQ1Bjon
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参加登録(必須): https://t.co/fP1r1yyCtx プログラム: 6月28日午前:「進化情報アセンブリ」領域紹介シンポジウム https://t.co/KMOeF0zHat 6月28日午後+29日:トヨタコンポン研 探査プロジェクト「未踏探索の原理と限界」公開シンポジウム https://t.co/hYUkGVhGjm
sites.google.com
シンポジウムは終了いたしました。ご参加いただきありがとうございました。
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学術変革A「進化情報アセンブリ」領域の紹介シンポジウムおよび領域と関係するトヨタコンポン研シンポジウム「未踏探索の原理と限界」を同時開催します。参加をお待ちしております!日時:6月28日(土), 29日(日) 場所:東京大学生産技術研究所 (現地およびオンラインのハイブリッド開催)
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